- Madrasah Quran
Madrasah Quran merupakan fasilitasi Pesantren Oncor Punthuk Sewu untuk anak-anak dan remaja di lingkungan Pesantren. Materi pengajarannya yaitu baca tulis huruf hijaiyah, membaca Al-Quran, dan kajian kitab kuning. Urgensi dari madrasah Quran ini yaitu untuk mensiapkan kader agama yang mumpuni dibidangnya dan bisa terjun untuk menjadi fasilitator sosial keagamaan di masyarakat.
- Sekolah Menengah Pertama (SMP).
Mengacu pada dokumen Cetak Biru dan Peta Jalan Pesantren 2024-2033, SMP Pesantren akan didirikan pada tahun 2027.
- Sekolah Menengah Atas (SMU).
Mengacu pada dokumen Cetak Biru dan Peta Jalan Pesantren 2024-2033, SMP Pesantren akan didirikan pada tahun 2030.
- Ma’had Aly
Pesantren Onchor Punthuk Sewu pada pengembangan Ma’had Aly atau pesantren tinggi berorientasi pada penyiapan keterampilan bagi lulusan-lulusan pesantren. Orientasi ini disusun dengan mempertimbangkan pelbagai kondisi sosial, ekonomi dan demografi lulusan pesantren yang tidak kesemuanya melanjutkan ke perguruan tinggi. Kapasitas, keterampilan dan permodalan menjadi persoalan yang mengemuka di kalangan lulusan pesantren, terutama pesantren salaf tradisional. Dalam kondisi tersebut, tuntutan kompetisi ekonomi yang tinggi mengharuskan alumni-alumni pesantren tersebut beradaptasi dan mempersiapkan keterampilan teknis dan non-teknis. Pesantren tinggi atau ma’had aly mengusung keunikan bentuk dan beberapa tema penting sebagai fokus dan orientasi pendidikan, yaitu pendalaman metodologi kajian keagamaan kontemporer, kecakapan hidup (life skill) pada bidang agribisnis yang mencakup peternakan dan pertanian, pendidikan ekologi, fasilitasi sosial dan riset.
Guna mendukung kepentingan tersebut, pesantren merencanakan penyediaan sarana pendidikan pertanian dan peternakan di sekitar kawasan pesantren yang digunakan sebagai wahana praktik santri. Jenis dan jumlah pendidikan keterampilan yang disediakan untuk santri ma’had aly dapat dikembangkan dan ditambah lebih lanjut berdasarkan kajian dan kesepakatan pengelola pesantren. Pengenalan agribisnis kepada santri ma’had aly menitikberatkan pada penerapan ekonomi sirkular. Melalui pendekatan ini, alumni diharapkan tidak semata mampu mengembangkan usaha petenakan dan pertanian, tetapi turut menjadi aktor penting untuk menjaga kelestarian alam.
Adapun fokus pendidikan pendalaman kajian agama secara umum meliputi Dirasah Islamiyyah, Al-Quran, Fiqih, Mantiq, Sejarah Islam Indonesia, Tasawuf, dan ekonomi I slam. Dikenalkan juga materi umum terkait keterampilan sebagai contoh pengenalan ekonomi sirkular, agribisnis, peternakan, pertanian, berikut manajemen pengelolaan, pengolahan serta pemasaran produksnya. Kajian yang terkait sosialpreneur kajian ilmu sosial, ekologi,riset sosial, dan pendampingan masyarakat.
- Pelatihan singkat
Pelatihan pertanian dan peternakan merupakan upaya pesantren Oncor Punthuk Sewu untuk memberikan bekal kepada perorangan atau kelompok yang memiliki atensi dibidang pertanian dan peternakan. Pelatihan singkat ini dilakukan dalam jangka waktu 6 bulan, adapun materi pelatihan mencakup model pengelolaan, pengolahan, dan pemasaran. Model pelatihan wirausaha ini membekali santri memiliki kecakapan dibidang agribisnis.